IF=38.1！奕谱生物全癌标志物进入防癌于未癌实操阶段

上海奕谱生物科技有限公司联合复旦大学生物医院研究院于文强团队、复旦大学附属肿瘤医院、空军军医大学附属西京医院团队鉴定了又一个全癌标志物--SIX6。这一联合团队在来自TCGA样本库的15种癌症类型的7010个样本中发现SIX6位点的高甲基化在肿瘤中具有普遍性。进一步地，通过收集了10种常见肿瘤的678个临床样本揭示SIX6的高甲基化是一个新的全癌标志物。相关研究成果于2022年7月6日发表在Nature子刊SignalTransductionandTargetedTherapy杂志上（IF=38.104）。

图1.全癌标志物SIX6在多种肿瘤以及众多临床场景中的应用

全癌标志物将肿瘤诊断提到“前癌”阶段，有望将肿瘤消灭在萌芽之中

癌症早筛关键在“早”，SIX6的高甲基化究竟出现得有多早？应用TCGA数据库样本，研究团队发现12种肿瘤中SIX6的高甲基化均出现在I期阶段，在临床样本中也证实SIX6的高甲基化出现在肺癌、乳腺癌和宫颈癌的早期阶段，且在癌症发展的全过程稳定存在，提示全癌标志物SIX6可用于肿瘤全流程监控。

基于肿瘤长期演化的特征，研究团队想知道SIX6的高甲基化在肿瘤发展的时间轴上能否更早？对此研究团队选取了具有阶段性进展特征的宫颈癌和胃癌样本，发现SIX6在高级别鳞状上皮内病变阶段就已经出现甲基化，提示应用全癌标志物可以将宫颈癌诊断提到更早期；而高胃癌风险样本也和胃癌一样，呈现出更高的SIX6甲基化水平，表明SIX6的高甲基化是肿瘤进展中的一个极早期事件，可以作为正常细胞向癌前细胞转变的一个重要特征，而该特征可以将“防癌”提前到“未癌”阶段。为了进一步加以应用，科研团队选取了无创的宫颈涂片和尿液样本，验证了SIX6的高甲基化出现在宫颈癌的早期——高级别鳞状上皮病变阶段。此外，研究团队还发现SIX6的高甲基化在区分子宫内膜癌、尿路上皮癌与相应良性疾病中具有很大优势。

肿瘤转移早知道、手术切沿精准判断

目前，有20%-30%的癌症在发现时就已经进展到了中后期阶段，癌细胞已扩散到附近的淋巴结、组织或器官，转移成为影响肿瘤治疗策略和预后的关键因素。既然SIX6的高甲基化出现的时间更早，那么SIX6的高甲基化能否用于肿瘤转移的“早”判断？研究团队通过在乳腺癌潜在转移阶段检测癌症淋巴结中SIX6的甲基化水平，发现阳性转移样本的淋巴结中SIX6也处于高甲基化状态，而阴性样本中则显著降低，表明SIX6的甲基化检测在追踪癌症的“早期转移”方面具有巨大的潜力和优势，有望让乳腺癌手术方式的选择不再依赖于经验，而是基于科学地精准决策。此外，临床上肿瘤切除术中，在无影灯下做到手到瘤除是每一个医生和患者的共同心愿。而肿瘤切除的手术切缘判定直接决定了肿瘤的预后，毕竟没有人希望在手术中“瘤下点什么”。研究团队在胃癌手术切缘样本的分析表明，手术切缘的SIX6甲基化水平依然高于对照的相对正常的样本，表明发生在分子水平的SIX6高甲基化比目前基于病理学判断的金标准在时间上可能更早且判读更灵敏。换一句话说，基于全癌标志物的肿瘤切沿判定可能更加精准。建立肿瘤手术切沿的表观遗传学判定标准也许是未来10年肿瘤外科领域研究的重要方向，SIX6的高甲基化有望成为这一方向上最重要的生物标志物之一。

上海奕谱生物科技有限公司由表观遗传学研究领域的著名学者于文强教授创立，此前已发表多项全癌标志物的重要成果，包括2019年在美国癌症研究协会官方杂志CancerRes(IF=13.312)上发表首个全癌标志物HIST1H4F，2021年在国际知名期刊ClinicalandTranslationalMedicine(IF=11.492)上发表第二个全癌标志物PCDHGB7，2022年在国际学术期刊FrontiersinMolecularBiosciences(IF=6.113)上揭示全癌标志物PCDHGB7在子宫内膜癌早期筛查中的应用。SIX6是奕谱生物发现的第三个全癌标志物。基于独特的GPS甲基化检测技术，奕谱生物已经开发了系列全癌标志物检测产品，其中TAGMe宫颈癌DNA甲基化产品已进入临床应用阶段。