第23届全国临床肿瘤学大会召开，华大数极携科研成果亮相卫星会

2020年9月19日-9月26日,第23届全国肿瘤学大会暨2020年CSCO学术年会召开。此次CSCO学术年会首次采取线上+线下的形式开展,数万名专家学者齐聚线上进行分享与讨论,打破时间和空间限制,共飨学术盛宴。

华大基因旗下新成立的专注癌症早筛早诊的子公司——华大数极在此次CSCO学术盛会之际,于9月20日召开以“防微杜渐 数极不惑”为主题的卫星会。华大数极创立于2019年,依托于华大基因在基因组学领域的基础科研成就,致力于癌症早筛服务,尤其是中国高发癌种的无创早期诊断技术开发,以期实现“精准早癌筛查,人人可及”的愿景。

此次卫星会中,华大数极邀请多位合作专家团队出席,包括复旦大学附属肿瘤医院蔡三军教授、中山大学附属第六医院吴小剑教授、复旦大学附属中山医院楼文晖教授、华大数极首席技术官汪宇盈博士、华大肿瘤事业部总经理和华大基因研发中心总监朱师达博士等,共话多组学基因检测肠癌早诊、胰腺癌早诊、肝癌早诊的技术研究与进展。

大会开场,会议主席蔡三军教授致辞

复旦大学附属肿瘤医院蔡三军教授表示,早发现、早诊断、早治疗是提高癌症治愈率的关键。华大数极致力于癌症,尤其是中国高发的消化系统癌症的无创早期诊断技术开发,其研发的新型液体活检技术可以高敏地检测血液中游离DNA中癌症特异性的基因组异常信号,从而实现高精度的癌症检测,为癌症的无创早期诊断和预后监控提供了创新的视角和技术路径,其最新的研究成果值得期待。

主题报告一:多组学基因检测肠癌早诊研究

中山大学附属第六医院吴小剑教授分享了与华大数极合作的“多组学基因检测肠癌早诊研究”项目的最新进展。该研究着重探索ctDNA驱动基因变异检测和表观组学变异检测在结直肠癌早诊领域的应用价值。数据显示,相对于肿瘤驱动基因变异,cfDNA表现出更明显的表观组学变异;基于肠癌特异性甲基化位点构建的诊断模型,其AUC高达0.91,并且在独立验证集中,全分期的灵敏度达到86.2%,特异性达到95.8%(图1)。同时,如果将肿瘤驱动基因变异分析和表观组学变异分析结合,可以在特异性95%的前提下,将检测灵敏度进一步提升至95.8%(图2)。这一结果揭示了多组学基因检测在肠癌早期诊断上的巨大应用潜力。

图 1 基于甲基化标志物的结直肠癌早诊技术性能

图 2 多维度数据整合可以有效提高检测灵敏度

主题报告二:胰腺癌早期诊断的前沿进展

复旦大学附属中山医院楼文晖教授分享了新型ctDNA检测技术在胰腺癌这个号称“癌中之王”的癌种上在早期诊断和预后分层上的应用。楼文晖主任和华大数极研发团队合作,首先基于胰腺癌组织样本数据筛选了胰腺癌特异性甲基化标志物,并在此标志物集合的基础上,利用血浆样本cfDNA数据的建立诊断模型(训练集)。在测试集中,该模型在95%的特异性下能达到87.9%的灵敏度(图3),在I期和II-IV期样本中分别实现了78.9%和90.0%的检测灵敏度,显示出甲基化变异作为新型液体活检标志物在胰腺癌早期诊断和早期筛查的巨大潜力。接着,该研究进一步探索基于ctDNA的液体活检技术对胰腺癌预后分层的可能性,发现基于肿瘤驱动基因突变和甲基化变异的评分均能对胰腺癌患者实现危险分层和预后评估 (图4),为液体活检技术在胰腺癌患者中提供了新的应用场景。

图 3 基于甲基化标志物的胰腺癌早诊模型在测试集中的性能

图 4 基于术前cfDNA携带的肿瘤驱动基因突变(Mutation score)和甲基化变异(MPS)的评分对胰腺癌患者实现预后分层

主题报告三:EpiPlexTM 肝癌早期诊断技术

华大数极首席技术官汪宇盈博士分享了数极研发团队和复旦大学附属中山医院肝癌研究所合作研发的甲基化液体活检技术的成果。

研究团队首先鉴定了肝癌的特征性甲基化标志物,然后利用华大数极的专利技术——甲基化快速靶向建库测序技(EpiPlexTM), 一次性检测包含25个基因的肝癌标志物组合的甲基化水平。该技术可以高敏地检测血液中游离DNA中肝癌特异性的、表观基因组层面的异常信号(图5),从而实现对早期肝癌的无创检测;其检测性能显著优于传统的肿瘤标志物(如甲胎蛋白AFP),尤其在0,A期的早期干细胞癌上实现了高达89.5%的检测灵敏度(健康人群特异性=93.7%;肝炎肝硬化人群特异性88.5%)(图6)。该技术未来有望应用于肝癌的早期筛查和诊断,助力肝癌精准防控。目前扩大临床验证和肝癌高危人群前瞻性队列研究即将启动,以充分评估该技术的临床应用价值。

图 5 肝癌特异性甲基化标志物变异负荷与分期的关系

图 6 基于甲基化标志物的诊断模型对于各分期肝细胞癌的诊断灵敏度

大会尾声,朱师达博士总结陈词

华大肿瘤事业部总经理、华大基因研发中心总监朱师达博士表示,在过去的几年内,基于血液检测等无创采样方式的癌症早期诊断和筛查技术的研究可以说是热点中的热点,研究机构和分子诊断企业都对此投入了巨大的热情和精力,并且也取得了一系列值得关注的研究成果。一方面,新的诊断标志物层出不穷;另一方面,检测技术的不断突破也在持续提升我们对痕量的肿瘤异常信号的捕捉能力。

本次卫星会分享的进展作为华大数极在癌症早筛早诊研究领域的阶段性成果,凸显了基因组学数据在筛查诊断方向的巨大应用潜力,也为下一步的技术优化和升级打下了一个坚实的基础。未来,华大数极将继续联合医学专家们,共同探究无创早癌筛查的技术极限,积极探索和扩展多组学创新技术的应用场景,秉持初心,力求更好的服务临床需求。

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