构建虚拟细胞需要哪些数据？看寻因一胞多维数据的版本答案

寻因生物与无尽方舟正式达成战略合作。双方将深度融合寻因生物的全单细胞创新数据能力与无尽方舟的 AI 虚拟细胞平台，共建 AI 虚拟细胞驱动的跨物种长寿靶点发现平台——以甲基化数据建模为核心锚点，共同探索跨物种长寿靶点的发现路径。

  本次合作中，寻因生物将依托SeekOne® DD数字液滴单细胞捕获系统，为无尽方舟提供覆盖表观组、转录组、蛋白组、空间组的高质量单细胞数据；无尽方舟则发挥其在 AI 虚拟细胞建模与跨物种靶点预测方面的优势，构建基于表观遗传特征的衰老靶点筛选模型。双方首期将围绕升级版 3 转录组 + 甲基化联合检测展开深度合作，并逐步拓展至 FFPE 转录组、5 转录组 + CRISPR 扰动、全序列 + 组蛋白修饰/核转录因子结合区等更多技术方向，以“干湿结合”的方式，打通从基础数据到药物靶点的全链路，加速 AI 虚拟细胞在长寿药物研发中的落地应用。

  数据底座：甲基化创新数据基座，3新升级试剂加持

  AI 虚拟细胞对训练数据的要求，早已越过“量”的阶段：细胞状态的多样性、表达背后的调控因果，才是决定模型能走多远的关键。虚拟细胞需要什么样的数据？2025年4月《Nature》的一篇Perspective给出了方向：下一代模型必须能同时整合基因组、转录组、表观组、蛋白质组和空间组数据，并在同一个细胞内建立这些模态之间的关联。文章特别指出，当前最大的瓶颈不是数据量，而是“配对的多模态数据”极度稀缺——当甲基化、RNA、蛋白质等信息来自不同细胞，AI只能学到相关性，无法建立调控与表达的因果链条。

  这意味着，虚拟细胞的“版本答案”，取决于谁能在一个细胞内同时完成多组学共检。

  本次合作中，寻因生物将依托SeekOne®DD数字液滴单细胞捕获系统，为无尽方舟提供覆盖表观组、转录组、蛋白组、空间组的高质量单细胞数据。值得一提的是，本次合作的数据体系有两大支撑：以寻因即将上市的 SeekOne®升级版 3 试剂体系为全程数据基座，以2026年 1 月刚于伦敦 FOG 大会上市的 SeekOne® DD 一胞多组甲基化技术为核心创新——基座更稳，创新更尖，让每一层数据都更完整、更优。

  • 一胞多组甲基化 + RNA+VDJ：DNA 甲基化是表观遗传调控的核心机制，随年龄呈现系统性变化，被称为“分子时钟”；它处在基因调控上游，决定基因能否被读取、何时被读取、以何种强度被读取，且在不同物种间高度保守，是跨物种衰老研究中极具潜力的对齐维度，寻因一胞多组学方案，让同一个细胞的甲基化与 RNA 被同时读取，建立起“调控 → 表达”的完整因果链条；

  • 3新升级试剂层：全新升级的 3 端试剂体系，让转录组数据的基因检出与稳定性再上一步——而这对AI虚拟细胞建模尤为关键：单细胞层面更高的灵敏度与基因检出数，意味着更完整的转录组信息输入，是虚拟细胞精准还原衰老调控网络、实现可靠靶点预测的数据底座；表达层的每一分提升，都会直接传导为模型训练数据的质量提升。

  All in SeekOne® DD：一个细胞内的多重信息

  支撑这套数据底座的，是寻因 SeekOne® DD 数字液滴平台一整套技术矩阵——单细胞、高通量、一个细胞内的多重信息共检。

  矩阵中面向高维数据需求的三条一胞多组学共检管线：

  一胞多组甲基化 + RNA+VDJ共检：

  同一细胞内同时读取 5mC/5hmC 甲基化信息与 3转录组，上万细胞高通量、单碱基分辨率、覆盖率高达 93%、转化率高达 99%；

  一胞多组ATAC + RNA 共检：

  染色质可及性与全长转录组一胞双组信息完全匹配，表观与表达，因果连贯；

  一胞多组空间 + RNA 共检：

  保留细胞空间原位信息，“真”单细胞分辨率，median gene 平均 1000+，一步开启单细胞亚群分析。

  矩阵之上，能力还在延展：全序列测序覆盖 noncoding、可变剪接、突变与融合信号；CUT&Tag+RNA测序确定组蛋白修饰或者核转录组因子结合与表型相关性；CRISPR 测序单次可实现上万 guide RNA 的高通量基因扰动研究；免疫组 TCR/BCR、表面蛋白、靶向扩增、胞内菌，再到 FFPE 珍贵样本的转录组挖掘——从调控到表达，从空间到扰动，一个细胞的多重信息，在同一个平台上被同时读取。

  持续深入，共同探索

  单细胞技术的研究逻辑正在层层深入：转录组回答“是什么”，空间组回答“在哪里”，甲基化回答“为什么”。当高质量、高维度的单细胞数据遇见人工智能，那些曾被认为过于复杂而无法建模的生命系统——比如衰老——开始变得可读取、可预测、可干预。

  另外值得一提的是：本次合作中支撑表达层数据的 3全新升级试剂体系，即将正式上市。它在高要求 AI 数据生产场景中的表现，值得单独讲一次——8 月，敬请期待。

  关于寻因生物

  寻因生物坚持研发一胞多组技术矩阵，致力成为每一位科研工作者创新发现的善器良台。以“单细胞表观·空间一胞多组技术驱动创新，解码生命未知”为愿景，致力开启单细胞甲基化表观组学新时代。公司围绕“All in One”技术理念，构建五大技术体系——中心法则全覆盖、一胞多模态共检、通用捕获胶珠、持续进化平台、全链条管线，形成覆盖DNA·RNA·蛋白全层级、一胞多组全维度、空间全场景的创新数据能力矩阵，并以多组、多维、单维三层技术矩阵与十余款“保险技术”，为每一份RNA数据上保险，让创新研究既敢想、也好做。

  寻因生物的技术积累与市场验证同样扎实：拥有SeekOne® DD数字液滴单细胞捕获系统等自主知识产权产品，累计申请专利130余项、软著20余项；支撑客户发表文章300余篇、累计影响因子超3000；服务海内外1000余家科研机构与生物医药企业，获评国家级专精特新“小巨人”企业，牵头及参与十四五等多项国家重点研发计划。

  关于无尽方舟

  无尽方舟是AI长寿药物研发领域备受瞩目的新锐力量。公司以基于单细胞数据信息增强、图神经网络GRN构建、基因分层架构等核心技术，覆盖线虫、小鼠（CRISPR KO/Activation老年鼠）、食蟹猴的模型迭代和靶点验证平台，构建面向生命科学的可验证的Longevity Foundation Model（长寿基础模型），并自研跨物种迁移学习模型通过对齐人、犬、猫、鼠的多组学数据，以域自适应神经网络筛除物种差异过大的信号，精准保留跨物种保守、与衰老显著相关、且更具成药潜力的候选靶点，在业内率先打通人药与宠物药一体化的研发路径。

  无尽方舟的团队与资本背书同样亮眼:创始人赵思邈为牛津大学AI医药方向博士，深耕衰老研究领域;CTO曾京昆师从诺贝尔奖得主Jennifer Doudna，一作发表里程碑级研究成果于《Cell》《Nature》;核心团队汇聚牛津、麻省理工、伯克利、剑桥等世界顶尖院校博士人才。公司成立不久即连续完成种子轮与种子+轮融资，累计超亿元，获得Monolith砺思资本、博裕资本、九合创投等知名机构的持续加注。